Projetos de pesquisa finalizados

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Projeto de pesquisa


  • Investigação do padrão de distribuição global do briozoário Zoobotryon verticillatum (Ctenostomata, Vesiculariidae) através de dados moleculares

     
  • Coordenador do projeto: Alvaro Esteves Migotto  
  • Autor ou executor principal do projeto: Karine Bianca Nascimento  
  • Número do projeto: 825  
  • Categoria: Mestrado 
  • Outra categoria: Zoologia 
  • Data de início das atividades no CEBIMar: 01/02/2013  
  • Data de término das atividades no CEBIMar: 31/07/2015  
  • Resumo: Os briozoários são animais lofoforados, coloniais e sésseis, distribuídos mundialmente e encontrados desde a faixa entremarés até áreas sublitorâneas. Zoobotryon verticillatum é uma espécie considerada bioinvasora em escala global, produzindo prejuízos ecológicos e econômicos pelas rápidas dimensões que suas colônias atingem. Alguns estudos indicam que a espécie pode ser facilmente dispersada por transporte humano. Pesquisas recentes baseadas em sequências de DNA sugerem que briozoários aparentemente cosmopolitas representem complexos de espécies crípticas regionalmente distribuídas, das quais algumas linhagens possuem potencial bioinvasor. Neste contexto, o padrão de distribuição global de Z. verticillatum será investigado, através da obtenção de sequências de DNA e da realização de análises filogenéticas e de genética populacional. Colônias de diferentes pontos da costa brasileira e de outras localidades do mundo serão estudadas. Análises preliminares de algumas sequências obtidas de espécimes do Brasil, EUA e Austrália sugerem que a espécie é composta por uma única linhagem mitocondrial. No entanto, estudos mais detalhados que considerem um número maior de indivíduos amostrados, uma escala geográfica mais ampla e genes nucleares devem ser realizados para testar esta hipótese.
     
  • Metodologia: As colônias serão coletadas manualmente por meio de mergulho livre ou autônomo, em substratos naturais rochosos e artificiais de regiões entremarés. Entre cinco a 15 exemplares por ponto amostral deverão ser coletados, com a finalidade de se detectar possíveis diversidades haplotípicas intra e inter populacionais. Os espécimes amostrados serão fixados em etanol 92-100% e posteriormente analisados sobre microscópio binocular para identificação e limpeza.
    Sequências de DNA de Z. verticillatum serão utilizadas como caracteres para a construção de hipóteses filogenéticas e como fonte de informação para as análises de genética populacional. Os marcadores escolhidos são segmentos dos genes mitocondriais COI (~1500pb) e 16S rRNA (~600pb); a fim de contrastar a informação proveniente de diferentes genomas, ao menos um marcador nuclear também será utilizado, a ser determinado logo no início do desenvolvimento deste projeto.
    As etapas de extração a preparo de reações para sequenciamento serão realizadas nas dependências do Laboratório de Genética Molecular do CEBIMar-USP, através de utilização de kits comerciais disponíveis.
     
  • Etapas e cronograma:
    Revisão da literatura:  1º, 2º, 3º e 4º semestres
    Disciplinas: 1º  semestre
    Coleta de material: 1º, 2º e 3º semestres
    Triagem/identificação de material: 1º, 2º e 3º semestres
    Obtensão de sequências: 1º, 2º e 3º semestres
    Análise de dados: 2º, 3º e 4º semestres
    Preparação da dissertação: 3º e 4º semestres
    Preparação de manuscritos: 3º e 4º semestres
    Defesa e depósito da dissertação: 4º semestre
     
     
  • Palavras-chave: Bryozoa, Zoobotryon verticillatum, genética de populações, bioinvasão 
  • Condições ambientais: Nenhuma condição especial ;   
  • Área necessária no laboratório: Laboratório de Genética Molecular do CEBIMar-USP: Bancada e equipamentos. Não há necessidade de áreas adicionais além do laboratório de genética molecular e demais salas (e equipamentos) sob responsa 
  • Equipamentos de laboratório: Computador, nanodrop, transiluminador, centrífuga, termociclador, termomixer, bomba a vácuo, pipeta, autoclave. 
  • Será necessário: Auxílio técnico para coleta de organismos ou observações de campo ;  Coleta antecipada de organismos ;  Utilização de embarcação do CEBIMar ;   

  • Outros serviços de laboratório: Não há. 
  • Organismos a serem coletados: Zoobotryon verticillatum (Bryozoa). 
  • Locais para coleta: Litoral do Brasil. 
  • Tipos de resíduos químicos e/ou infectantes a serem gerados durante o projeto:  
  • Quantidade de cada tipo de resíduo:
  • Periodicidade aproximada da geração dos resíduo:
  • Instituição(ções) de origem do projeto:

    • USP. Centro de Biologia Marinha   
    • USP. Instituto de Biociências  Departamento de Zoologia 
     
  • Participante(s) do projeto:

    • Nome: Karin Hoch Fehlauer-Ale  
    • Função no projeto: Co-orientador 
    • Início das atividades no projeto: 01/02/2013  
    • Fim das atividades no projeto: 31/01/2015  
     
  • Recurso(s) destinado(s) ao projeto:

    • Situação: Concedido 
    • Agência de fomento: CNPq 
    • Tipo de recurso: Bolsa 
    • Especificar o tipo de recurso: Bolsa de mestrado 
     

    Produção(ões) bibliográfica(s) gerada(s) pelo projeto:

    Total de produções bibliográficas: 0


  • Data de cadastro do projeto: 08/03/2013  
  • Data da última modificação: 23/05/2013  
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