Projetos de pesquisa finalizados

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Projeto de pesquisa


  • Identificação e caracterização de moléculas bioativas em esponjas marinhas:estudos moleculares e celulares

     
  • Coordenador do projeto: Glaucia Maria Machado-Santelli  
  • Autor ou executor principal do projeto: Marcel Shiniti Urabayashi  
  • Número do projeto: 820  
  • Categoria: Doutorado 
  • Data de início das atividades no CEBIMar: 01/02/2013  
  • Data de término das atividades no CEBIMar: 31/01/2015  
  • Resumo: O problema crescente de resistência das bactérias patogênicas a antibióticos con-vencionais e comprometimento do sucesso da quimioterapia pelo desenvolvimento de resistência pelas células cancerosas, tem impulsionado a busca por novos composto bio-ativos na natureza. Além disso, existe também a necessidade de buscar novas moléculas de atividade antitumoral para o tratamento quimioterápico.Deste modo, o presente projeto tem por objetivo a identificação e caracterização de compostos com atividade antibacteriana e antiproliferativa seletiva para células tu-morais. Para a identificação de compostos bioativos em extrato de organismos marinhos, nosso objetivo é comparar os compostos bioativos extraídos a partir de extratos brutos, compostos purificados destes, com os mensageiros de AMPs obtidos de organismos desafiados em tempos curtos de aqüicultura. A elucidação dos mecanismos de ação dos compostos classificados como bioativos dará seqüência a esta fase inicial do desenvolvimento do projeto e nesta fase anali-saremos o seu potencial antiproliferativo (eventualmente antitumoral), a possibilidade de síntese e/ou modificação in vitro, sua seletividade contra alvos específicos.
     
  • Metodologia: Espécie de esponjaA espécie de esponja a ser utilizada no presente trabalho será: Amphimedon viridis. As amostras serão coletadas e serão fixadas em solução de RNAlater (Sigma-Aldrich).O estresse no grupo de esponjas será realizado em aqüicultura, onde algumas ho-ras em aquário mudarão o metabolismo regular das esponjas, enquanto que o grupo controle será fixado logo após a coleta do material. A partir dessa diferença  entre os grupos será feita a biblioteca subtrativa de cDNA.Preparação e análise das bibliotecas subtrativas Basicamente esta técnica utiliza cDNAs de indivíduos controle para remover as mensagens “normais” de uma preparação de cDNAs de indivíduos imunologicamente desafiados. A fração resultante de sucessivos PCRs é enriquecida em até mil vezes com mensagens relativas à defesa. Esta metodologia está disponível comercialmente em forma de “kits” com protocolos padronizados e custo bastante acessível.Publicações recentes mostraram ser possível a utilização de um método prático e de baixo custo para o isolamento e identificação de mensageiros codificando elementos efetores ou reguladores de defesa.
     
  • Etapas e cronograma: 1o semestre de 2013- coleta de material e preparação dos bancos2o semestre de 2013- sequenciamento do clones obtidos1o semestre de 2014- teste de bioatividade das sequencias de interesse2o semestre de 2014- analise final dos dados e redação da tese
     
  • Palavras-chave: esponjas, peptideo, anti-proliferativo, anti-microbiano 
  • Condições ambientais: Maré baixa ;   
  • Área necessária no laboratório: local para guardar material 
  • Equipamentos de laboratório: freezer  
  • Será necessário: Auxílio técnico para coleta de organismos ou observações de campo ;  Utilização de embarcação do CEBIMar ;   

  • Outros serviços de laboratório: nao 
  • Organismos a serem coletados: esponja- Amphimedon viridis. 
  • Locais para coleta: Praia Preta de Sao Sebastião  
  • Tipos de resíduos químicos e/ou infectantes a serem gerados durante o projeto:  
  • Quantidade de cada tipo de resíduo:
  • Periodicidade aproximada da geração dos resíduo:
  • Instituição(ções) de origem do projeto:

    • USP. Instituto de Ciências Biomédicas  departamento de biologia celular e do desenvovimento 
     
  • Participante(s) do projeto:

    • Nome: Glaucia Maria Machado-Santelli  
    • Função no projeto: Outra função 
    • Início das atividades no projeto: 01/02/2013  
    • Fim das atividades no projeto: 30/01/2015  
    • Nome: Marcel Shiniti Urabayashi  
    • Função no projeto: Doutorando 
    • Início das atividades no projeto: 01/02/2013  
    • Fim das atividades no projeto: 30/01/2015  
     
  • Recurso(s) destinado(s) ao projeto:

    • Situação: Concedido 
    • Agência de fomento: Fapesp 
    • Tipo de recurso: Auxílio á pesquisa 
    • Especificar o tipo de recurso: Reserva técnica 
    • Recursos em nome de: Marcel Shiniti Urabayashi 
     

    Produção(ões) bibliográfica(s) gerada(s) pelo projeto:

    Total de produções bibliográficas: 0


  • Data de cadastro do projeto: 04/02/2013  
  • Data da última modificação: 19/04/2013  
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