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Projeto de pesquisa


  • Comunidade Bacteriana Associada ao Coral-Sol, Tubastraea coccinea (Scleractinia: Dendrophylliidae), da Costa do Brasil

     
  • Coordenador do projeto: Marcelo Visentini Kitahara  
  • Autor ou executor principal do projeto: Laiza Cabral de Faria  
  • Número do projeto: 997  
  • Categoria: Mestrado 
  • Data de início das atividades no CEBIMar: 31/07/2018  
  • Data de término das atividades no CEBIMar: 30/01/2020  
  • Resumo: A relação entre o coral e a microbiota associada a ele é essencial para sua sobrevivência. Diversos fatores ambientais podem influenciar na composição desta comunidade microbiana, como temperatura, pH e salinidade. O projeto tem como objetivo caracterizar a comunidade bacteriana associada a corais invasores da espécie Tubastraea coccinea presentes em diferentes localidades do litoral brasileiro, por meio da técnica de metabarcoding, e relacionar esses resultados com dados ambientais do local. A hipótese é que se as bactérias forem uma herança do entorno, então a composição da comunidade bacteriana associada ao coral irá variar conforme sua localidade de origem, independentemente da colônia que ele está estabelecido. Uma vez que os corais se reproduzem assexuadamente, formando clones, as associações bacterianas podem ser herança do indivíduo, e não do entorno.
     
  • Metodologia: As coletas de material biológico que será utilizado já foram realizadas através de mergulho autônomo, entre 2012 e 2017, e as amostras se encontram fixadas e armazenadas a -20º. Foram coletadas três amostras de coral por ponto, sendo 15 pontos ao longo da costa brasileira, entre os estados de Santa Catarina e Ceará, totalizando 45 amostras.
    Utilizaremos um kit de extração de DNA para extrair DNA genômico total das bactérias, a partir de partes de tecido do coral. A técnica reação de polimerase em cadeia (PCR) será utilizada para amplificar parcialmente o gene 16S rDNA bacterial. Os produtos da PCR serão então enviados para sequenciamento.
    Sequências do gene 16S rDNA bacterial disponíveis em bancos de dados, como GenBank, serão utilizadas para a criação de uma biblioteca de referência, para então os dados referentes às amostras serem analisados. O processamento e a análise das sequências serão realizados no software de livre acesso Usearch v9.0.
     
  • Etapas e cronograma: Extração de DNA - de 01/08/2018 até 30/09/2018
    PCR - de 01/10/2018 até 28/02/2019
    Análise das sequências e estatísticas - 01/05/2019 até 30/09/2019
    Redação do artigo - 01/10/2019 até 31/01/2020
     
  • Palavras-chave: Metabarcoding; simbiose; microbiota 
  • Área necessária no laboratório: Bancada para realização de extração de DNA; mesa para uso diário. 
  • Equipamentos de laboratório: Freezer e geladeira; cabine de PCR; centrifuga de microtubos; termociclador; fonte e cuba de eletroforese; micropipeta; transiluminador; nanodrop. 
  • Outros serviços de laboratório: Nenhum. 
  • Organismos a serem coletados: Organismos já coletados. 
  • Locais para coleta: Organismos já coletados. 
  • Tipos de resíduos químicos e/ou infectantes a serem gerados durante o projeto: Plásticos não contaminantes. 
  • Quantidade de cada tipo de resíduo: 5kg.
  • Periodicidade aproximada da geração dos resíduo: Diária, durante o período de extração e amplificação.
  • Instituição(ções) de origem do projeto:

    • USP. Centro de Biologia Marinha  e Universidade Federal do Paraná 
     
  • Participante(s) do projeto:

    Nenhum participante incluído.
     
  • Recurso(s) destinado(s) ao projeto:

    • Situação: Concedido 
    • Agência de fomento: Fapesp 
    • Tipo de recurso: Auxílio á pesquisa 
    • Especificar o tipo de recurso: Benefícios complementares de projeto Jovem Pesquisador 
    • Recursos em nome de: Marcelo Visentini Kitahara 
     

    Produção(ões) bibliográfica(s) gerada(s) pelo projeto:

    Total de produções bibliográficas: 0


  • Data de cadastro do projeto: 13/07/2018  
  • Data da última modificação: 27/08/2018  

          

            Notícias

    

                  

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