Projetos de pesquisa em andamento

Acesso a área restrita.

Entre para cadastrar ou atualizar seus projetos de pesquisa ou submeter novas solicitações de apoio a projetos.
Obter nova senha - Receber nome de usuário por e-mail - Criar uma conta

Projeto de pesquisa


  • Filogenômica da ordem Scleractinia (Cnidaria, Anthozoa): relações entre evolução da ordem e mudanças climáticas

     
  • Coordenador do projeto: Marcelo Visentini Kitahara  
  • Autor ou executor principal do projeto: Isabela Galvão de Lossio e Seiblitz  
  • Número do projeto: 975  
  • Categoria: Mestrado 
  • Data de início das atividades no CEBIMar: 26/11/2017  
  • Data de término das atividades no CEBIMar: 31/12/2019  
  • Resumo: Os corais escleractíneos são metazoários basais pertencentes ao filo Cnidaria que se encontram ameaçados pelo aumento da temperatura global e pela acidificação dos oceanos. Essas mudanças climáticas estão associadas à morte ou saída de algas endossimbiontes (zooxantelas) dos corais, assim como à dissolução do esqueleto carbonático desses cnidários. A ordem Scleractinia, à qual esses organismos pertencem, não teve ainda sua história evolutiva totalmente resolvida, havendo incertezas quanto à filogenia de suas subordens e, até mesmo, quanto ao seu monofiletismo. Essa dificuldade se deve, principalmente, ao baixo número de táxons usados nas filogenias, em especial espécies de corais azooxantelados. Além disso, o baixo número de marcadores pode também ser uma causa de variação entre as topologias de diferentes filogenias dessa ordem. Dessa forma, o presente projeto tem como objetivo principal recuperar a história evolutiva de Scleractinia com base em genomas mitocondriais. Para isso, serão analisadas por sequenciamento de última geração (NGS) 50 espécies de corais zooxantelados e 50 de azooxantelados. Nessas filogenias, fatores paleoclimáticos serão mapeados através de calibração por meio de relógio molecular. Essa técnica permitirá identificar o momento no qual certas características surgiram ou desapareceram e auxiliar na elaboração de hipóteses a respeito do futuro desses organismos frente às mudanças climáticas.
     
  • Metodologia: Cem espécies de corais escleractíneos terão seu DNA mitocondrial analisado. Para tal, a maioria das amostras foi obtida de instituições em diferentes países, entre eles França e Austrália, e já se encontra disponível para uso. Esses espécimes terão seu genoma mitocondrial extraído com um kit comercial de extração por coluna e sequenciado na plataforma HiSeq2500 (Illumina). Uma vez que os genomas das diferentes espécies tenham sido sequenciados, terá início o processo de garimpagem dos genomas mitocondriais e sua montagem com o uso de programas como Geneious (http://www.geneious.com; Kearse et al., 2012) e Sequencher (Gene Codes Corporation). Para investigação das relações evolutivas presentes entre essas espécies, os genomas montados serão utilizados em análises mitofilogenômicas, juntamente com dados já publicados (Chen et al., 2008; Kitahara et al., 2014). Os genomas serão analisados na forma de sequências de nucleotídeos e de aminoácidos. Dados paleoambientais serão mapeados nas filogenias prontas por meio do uso de relógio molecular, associando fósseis a determinados nós das árvores. Com isso, será possível observar as respostas evolutivas dessa ordem a diferentes condições ambientais, assim como mapear o surgimento e o desaparecimento de características em Scleractinia.
     
  • Etapas e cronograma: 1. Extração de DNA, preparação de bibliotecas para sequenciamento de última geração e sequenciamento (2018 - primeiro semestre);
    2. montagem de genomas mitocondriais (2018 - primeiro e segundo semestres);
    3. análises filogenômicas e de relógio molecular (2018 - segundo semestre; 2019 - primeiro semestre);
    4. redação da dissertação de Mestrado e sua defesa (2019 - primeiro semestre).
     
  • Palavras-chave: coral; genoma mitocondrial; genômica; genética 
  • Condições ambientais: Nenhuma condição especial ;   
  • Área necessária no laboratório: Laboratório Molecular 
  • Equipamentos de laboratório: Equipamentos para análises moleculares, como termociclador, espectrofotômetro de microvolumes, fluxo laminar, transiluminador, fonte e cuba de eletroforese, centrífuga, micropipetas, espaço na gelade 
  • Outros serviços de laboratório: Nenhum 
  • Organismos a serem coletados: Nenhum 
  • Locais para coleta: Nenhum 
  • Tipos de resíduos químicos e/ou infectantes a serem gerados durante o projeto: Álcool, tampões (TAE ou TBE) e plásticos (ponteiras de micropipeta, microtubos, etc) utilizados em análises moleculares. 
  • Quantidade de cada tipo de resíduo: Álcool: 1 L/ano; tampões: 5 L/ano; plásticos: 1 kg/mês.
  • Periodicidade aproximada da geração dos resíduo: Álcool: 1 L/ano; tampões: 5 L/ano; plásticos: 1 kg/mês.
  • Instituição(ções) de origem do projeto:

    • Outra instituição  Unifesp. Universidade Federal de São Paulo 
     
  • Participante(s) do projeto:

    Nenhum participante incluído.
     
  • Recurso(s) destinado(s) ao projeto:

    • Situação: Concedido 
    • Agência de fomento: Fapesp 
    • Tipo de recurso: Bolsa 
    • Especificar o tipo de recurso: Projeto nº 2017/11615-7 
    • Recursos em nome de: Isabela Galvão de Lossio e Seiblitz 
    • Situação: Concedido 
    • Agência de fomento: Fapesp 
    • Tipo de recurso: Auxílio á pesquisa 
    • Especificar o tipo de recurso: Auxílio Jovem Pesquisador nº 2014/01332-0 
    • Recursos em nome de: Marcelo Visentini Kitahara 
     

    Produção(ões) bibliográfica(s) gerada(s) pelo projeto:

    Total de produções bibliográficas: 0


  • Data de cadastro do projeto: 08/11/2017  
  • Data da última modificação: 07/12/2017  

          

            Notícias

    

                  

Rodovia Manoel Hypólito do Rego, km. 131,5 - Pitangueiras - São Sebastião - SP - Brasil - CEP 11612-109 e-mail: O endereço de e-mail address está sendo protegido de spambots. Você precisa ativar o JavaScript enabled para vê-lo. O endereço de e-mail address está sendo protegido de spambots. Você precisa ativar o JavaScript enabled para vê-lo.             
Joomla 1.6 Templates designed by Joomla Hosting Reviews