Projetos de pesquisa em andamento

Acesso a área restrita.

Entre para cadastrar ou atualizar seus projetos de pesquisa ou submeter novas solicitações de apoio a projetos.
Obter nova senha - Receber nome de usuário por e-mail - Criar uma conta

Projeto de pesquisa


  • Células-tronco, regeneração e a evolução da colonialidade em ascídias    

     
  • Coordenador do projeto: Federico David Brown Almeida  
  • Autor ou executor principal do projeto: Federico David Brown Almeida  
  • Número do projeto: 874  
  • Categoria: Projeto temático 
  • Data de início das atividades no CEBIMar: 01/07/2014  
  • Data de término das atividades no CEBIMar: 30/06/2018  
  • Resumo:  
    Diversas espécies de cordados perderam a sua capacidade de regenerar estruturas adultas por completo. No entanto, cordados marinhos com formas de vida sedentárias e coloniais, e.g., os tunicados, possuem um potencial notável de regeneração, possivelmente relacionado com a sua capacidade de se reproduzir clonalmente, por brotamento. Eu proponho estudar os mecanismos de brotamento em tunicados coloniais estielídeos com diferentes capacidades regenerativas, que evoluíram a partir de um ancestral comum solitário. A reconstrução das alterações no desenvolvimento ao longo da evolução do brotamento neste grupo nos permitirá compreender a natureza plástica e a origem das células e tecidos progenitores em nosso próprio filo e, em última instância, compreender restrições no desenvolvimento das células- tronco humanas durante a regeneração de tecidos perdidos. Aspectos celulares e moleculares do brotamento e da regeneração têm sido bem estudados no estielídeo colonial Botryllus schlosseri. Aqui, propomos estudar três espécies distintas com um menor grau de integração colonial: (1) a espécie colonial Symplegma brakenhielmi, (2) a espécie social Eusynstyela floridana, e (3) a espécie solitária Styela plicata. Estudos genômicos nessas três espécies, associados à caracterização transcriptômica das células-tronco originadas a partir de tecido sanguíneo, nos permitirão identificar mecanismos regulatórios gênicos em regiões codificantes (mRNAs) e não-codificantes (ncRNAs) de diferentes tipos de células-tronco circulatórias, responsáveis pela evolução do brotamento neste grupo. Nós testa 
  • Metodologia:  
    We plan to maintain long-term cultures of Symplegma brakenhielmi and Eusysntyela floridana in the laboratory to initiate the characterization of developmental stages of budding for each species and unravel evolutionary transitions of budding in the styelids. S. brakenhielmi and E. floridana will be collected at CEBIMAR-USP in São Sebastião and around the Port of Santos by scuba-diving and snorkeling. At CEBIMAR, we have already developed artificial crates that allow us to grow large colonies of styelid ascidians in the field for cellular and developmental studies. In addition, colonies will be cultured in the laboratory in re-circulatory marine systems both at the CEBIMAR in São Sebastião and at the Departmento de Zoologia IB-USP. Together with the graduate students (Doc A and Doc B) and tech TT3 we will maintain clonal lines of each colony, and attempt to induce sexual reproduction to generate crosses between colonies for future genetic studies, and most importantly to generate an inbred line for genome sequencing of colonial S. brakenhielmi, and social E. floridana.
      
     
  • Etapas e cronograma:  
    Activities - SEMESTERS
    Ascidian collection - 1st to 2nd
    Rearing and culture (inbred lines) - 1st to 3rd
    General descriptions of budding (in vivo, histology) - 1st to 2nd
    Colony manipulations (cell or tissue dissection, plasma transfusion) - 2nd to 8th
    Gene expression (IHC and in situ hybridization) - 2nd to 8th
    Blood derived stem cell isolation and sorting (FACS) - 3rd to 4th
    Whole transcriptome sequencing (ncRNAs and mRNAs) - 4th to 5th
    Transcriptome analyses - 5th to 8th
    Genomes sequencing - 3th to 4th
    Genome assembly and annotation - 4th to 8th
     
  • Palavras-chave: ascidians, coloniality, evolution, regeneration, stem cells 
  • Área necessária no laboratório: Bancada e pia na sala de triagem do laboratório Paulo Sawaya; Laboratório de Genética Molecular Erasmo Garcia Mendes 
  • Equipamentos de laboratório: Aparelho de eletroforese; Aquários; Balança; Bancadas com água doce e do mar corrente; Centrífuga; Incubadora; Estereomicroscópio; Geladeira; Microscópios óptico e de fluorescência; Vidraria básica  
  • Será necessário: Montagem de alguma estrutura (estantes, aquários etc) ;  Colocação ou fundeio de alguma estrutura no mar ;  Auxílio técnico para manutenção de estruturas ou material biológico na ausência dos participantes do projeto ;  Auxílio técnico para coleta de organismos ou observações de campo ;  Coleta antecipada de organismos ;  Utilização de embarcação do CEBIMar ;   

  • Outros serviços de laboratório: Não há. 
  • Organismos a serem coletados: Spp. diversas de Ascidiacea: Symplegma brakenhielmi, Eusysntyela floridana, Styela plicata 
  • Locais para coleta: Litoral de São Sebastião e Ilhabela 
  • Tipos de resíduos químicos e/ou infectantes a serem gerados durante o projeto:  
  • Quantidade de cada tipo de resíduo:
  • Periodicidade aproximada da geração dos resíduo:
  • Instituição(ções) de origem do projeto:

    • USP. Instituto de Biociências   
     
  • Participante(s) do projeto:

    Nenhum participante incluído.
     
  • Recurso(s) destinado(s) ao projeto:

    • Situação: Solicitado 
    • Agência de fomento: Fapesp 
    • Tipo de recurso: Auxílio á pesquisa 
    • Especificar o tipo de recurso: Bolsas de auxílio à pesquisa, nível de Mestrado, Doutorado, Pós-Doutorado e Treinamento Técnico. 
    • Recursos em nome de: Federico David Brown Almeida 
     

    Produção(ões) bibliográfica(s) gerada(s) pelo projeto:

    Total de produções bibliográficas: 0


  • Data de cadastro do projeto: 30/04/2014  
  • Data da última modificação: 11/11/2014  
Joomla 1.6 Templates designed by Joomla Hosting Reviews